当前的问题
目录：2022
这项研究旨在检查姜黄素（一种植物化学抗氧化剂）对糖尿病肾病的治疗和护理的影响，并为糖尿病的替代治疗策略做出贡献。雄性Wistar白化大鼠（8-10周龄）分为五组七组。除1组（安慰剂组）通过110 mg/kg烟酰胺，然后在55 mg/kg链蛋白酶的腹膜内给药（15分钟后），诱导了所有大鼠实验性糖尿病。用0.1 mL正常盐水（0.9％NaCl），150mg/kg/day二甲双胍，10 mg/kg/day Glycazide（Diamicron）和200 mg/kg/day Curcumin治疗组1、3、4和5组。。第2组未接受任何治疗。收集大鼠的肾脏组织进行组织病理学检查。大鼠的肾脏尺寸没有显着差异。在糖尿病肾病的肾脏组织的组织病理学评估中，观察到肾小球充血和破坏。基于组织病理学分析，接受姜黄素治疗的大鼠的肾脏损伤明显少于糖尿病药物治疗的大鼠。我们得出结论，姜黄素由于其抗氧化特性而在肾脏中具有保护作用。 It has potential for use, in addition to antidiabetic drugs, for diabetes treatment.
我们研究了四个基因的单核苷酸多态性（钙蛋白酶（CAPN-9和CAPN-14），calpastatin -投掷，二酰基甘油酰基转移酶 -DGAT和瘦素 -LEP）与牛肉质量有关，我们检查了它们在内洛尔牛中编码的蛋白质合成的变化。分析了来自95名成年男性商业起源的样本。从中提取基因组DNAlongissimus redorsi（牛lo）肌肉组织，用PCR链构象多态性分析鉴定。对于确定的每个不同模式，将产品发送用于测序和使用序列扫描仪软件进行分析。通过确定每个基因中确定的多态性的绝对频率和相对频率来分析数据。为了CAPN-9基因测序显示五种多态性（g/a，t/a，t/c，t/c和a/g），其中两个涉及氨基酸取代（c.5861g> a和c.5498a> g）。测序CAPN-14基因揭示了四个多态性（A/C，G/A，T/C和C/G），其中两种涉及氨基酸取代（C.11054 T> C和C.11161C> G）。测序Cast-5基因揭示了五种多态性（C/T，T/C，C/A，C/A和G/T），其中四个涉及氨基酸取代（C.29919C> T，C.29963A> C，C.29978C，C.29978C> a和c.30019g> t）。测序DGAT基因揭示了六种多态性（T/A，G/A，A/T，G/C，A/G和G/A），其中四个涉及氨基酸取代（C.11730A> T，C.11809G> C，C.11858A> g和C.11927G> a）。测序LEP基因揭示了三种多态性（C/T，C/T和T/C），其中一种涉及氨基酸取代（C.14962T> g）。这些基因具有大量的多态性，导致内洛尔牛的氨基酸差异。鉴于这些基因与牛肉质量参数相关，涉及氨基酸变化的这些涉及氨基酸变化的多态性可能会促进Nellore牛的牛肉特征的功能变化。
cynodon dactylon（Bermudagrass）ISE用于巴西牧场以及草坪，公园和运动场的觅食。但是，在甘蔗田中，由于其快速适应和生长机制，很难控制杂草。它与对农作物产量产生负面影响的甘蔗植物竞争。百慕大拉斯具有多倍体和易于杂交，可促进高多态性，从而产生对环境的不同反应。因此，了解百慕大拉斯的结构和可变性对于制定其作为杂草的策略的制定变得很重要。我们研究了从圣保罗州（巴西）的甘露纳田（Bermudagrass）的五个人群（SP1至SP5）的遗传变异性和结构的水平。使用了13个微卫星。PCOA表现出结构结果（K = 4），显示了SP1和SP3种群的混合物，SP2，SP4和SP5是最遥远的。DAPC还证实了SP1和SP3的低遗传分化。由于该物种的营养生长占主导地位，因此遗传变异性比人群中的变异更大，这会促进低多样性，并且由于地理距离而降低了基因流动，甚至使其变得不可行。 The SSRs showed high resolution in characterizing the genetic diversity and structure of the five populations of Bermudagrass. The findings of this study may help to establish biological control methods against Bermudagrass in sugarcane fields.
SARS-COV-2大流行证明了对基因组流行病学监测的必要性。迄今为止，已经应用了各种方法，包括宏基因组方法和与高通量测序平台相关的基于扩增的测序。我们使用SARS-COV-2社区面板（Illumina Ampliseq）在基于扩增子的测序中调整了一些细节，并使用Miseq平台进行了其他修改，以实现平衡和高质量的测序。修改后的方案用于检测巴西Goiás州的循环SARS-COV-2变体。最初，从12月/2020年和2021年2月/2021年的15例患者那里获得了RNA样品，以验证协议步骤。图书馆是按照Ampliseq进行的，以进行Illumina工作流，并进行修改；随后，我们分析了从2020年12月至2021年7月从Goiás收集的305个阳性样品。为了改进协议，我们取消了使用DNase处理样品的需求，并证明了图书馆稀释前后QPCR对量化的重要性。在用生物分析仪分析的样品中未观察到碎片模式。库返回用于基因组组装和变体检测的测序结果。我们能够从318个样品中组装出SARS-COV-2基因组，这些样本用于鉴定在Goiás中循环的13种变异性冠状病毒。 Variants of concern, such as Alpha (B.1.1.7), Gamma (P.1) and Delta (B.1.617.2) were detected; the latter was detected at first in Goiás in April 2021. The modifications in the workflow we developed were successfully applied to detect SARS-CoV-2 variants, resulting in high coverage genome assembly, and they can be used to increase the number of genome sequences and aid in epidemiological surveillance in Brazil.
氮管理明显影响小麦耳朵成分和谷物产量之间关系的表达和幅度。我们试图确定与小麦耳朵相关的变量，这些变量对氮供应的剂量和形式的变化更敏感，并确定大豆/小麦和玉米/小麦的单一和小数氮供应对谷物产量的直接和间接影响系统。这项研究于2018年和2019年在随机块实验设计中进行了四个复制，在3 x 3阶乘中，用于N-肥料剂量（30、60、120 kg ha-1）和供应形式[单剂量[100（100）％）在物候阶段V3（第三叶叶）；V的分级剂量（70％和30％）3/v6物候阶段（第三和第六叶叶）和；物候阶段V的分级剂量（70％和30％）V3/r1（分别在大豆/小麦和玉米/小麦继承系统中分别扩大第三叶和谷物填充的开始）。氮剂量的增加会促进由于晶粒质量和v剂量在V中的贡献较大而促进生产率。3V中的阶段和耳纹质量3/v6和v3/r1，在大豆/小麦系统中。在玉米/小麦系统中，氮的增加可促进生产力，而不论供应形式如何，耳朵中的晶粒质量更大。单剂量的氮供应（V3）并在v中分离3/v6给出了相似的生产率，v降低了3/r1。耳朵的晶粒质量表现出更大的改变，而不论剂量和继承系统如何，单氮和分数的氮供应形式更大。耳朵的晶粒质量与产率相关，无论大豆/小麦系统中氮供应的剂量和形式如何，耳朵质量的间接效应为正。在玉米/小麦系统中，当氮在30和60 kg ha的单剂量以单剂量提供时，耳粒质量与产率相关。-1，由于耳长而产生积极的间接作用。
谷胱甘肽S-转移酶是排毒酶，可保护细胞免受氧化应激并有助于维持基因组完整性。GSTM和GSTT家族基因可能会被删除，导致降低或没有谷胱甘肽S-转移酶活性，从而无法有效消除亲电癌。这种遗传改变会影响癌症的发病率和预后。我们进行了基因分型GSTM1和GSTT1在87名巴西白血病患者中，多重PCR分为急性或慢性病，以及淋巴细胞或髓样型癌症。GSTM1- 不和GSTT1- 慢性白血病（67.65％和46.20％）和慢性小球白血病（29.41％和12.30％）的效率显着高于对照组的频率。不仅如此，双重无效的基因分型在急性白血病中比对照组明显更多。当个人GSTM1和GSTT1分析基因分型，与对照组相比（11.11％和3.8％），基因分型频率的CML和CLL在基因分型频率上显着不同。急性淋巴白血病中的双重无效基因型比对照组明显高得多。此外，CML患者的统计学意义上的较高百分比是双记号和GSTM1- 无基因型和CLL患者的频率明显更高GSTT1- 与对照组相比，无基因分型。我们建议，GST基因型是巴西人口中白血病发展的重要危险因素，尤其是由于氧化应激产物的排毒效率低下而导致的慢性白血病。
心脏纤维化是常见的，并且在许多心脏病中有害，影响了全世界数百万的患者。心脏纤维化的特征是过量产生细胞外基质（ECM）成分，例如原纤维胶原，由活化的心脏成纤维细胞产生，即：肌纤维细胞。心脏纤维化的治疗靶向非常有吸引力。但是，这仍然是一个主要的医疗挑战。纤维瘤蛋白是在ECM中局部的富含亮氨酸的小蛋白聚糖。纤维蛋白与胶原蛋白原纤维结合，并在几个器官中促纤维化细胞因子转化生长因子β（TGFβ）的胶原原纤维生成，ECM组织，伤口愈合和调节中起关键作用。在小鼠和心力衰竭的患者中，纤维瘤蛋白高度上调，但对其在心脏纤维化中的作用知之甚少。我们最近从新生大鼠心脏的心脏成纤维细胞的原发性培养物中发现的结果表明，纤维瘤蛋白具有抗纤维化作用。在这里，我们通过过表达培养的人类胎儿和成人心脏成纤维细胞中的纤维瘤蛋白来研究这些发现的翻译价值。通过QPCR和基因阵列测量了纤维瘤蛋白过表达对基因表达的影响，而蛋白质水平通过蛋白质印迹测量，并通过放射性脯氨酸掺入来测量胶原蛋白的合成。 The results support our previous findings and indicate relevance for human disease. We found that fibromodulin reduced the expression levels of the collagen cross-linking enzymes lysyl oxidase (熏鲑鱼）和转谷氨酰胺酶2（TGM2）。纤维瘤蛋白还降低了结缔组织生长因子的水平（CTGF）和骨膜素（邮政），表明TGFβ活性降低。细胞间粘附分子的水平降低（1ICAM1）和血管细胞粘附分子1（VCAM1）建议降低免疫细胞粘附的潜力，基因阵列表明整联蛋白表达改变，表明ECM细胞粘附改变了。原纤维胶原的表达不受影响。总之，纤维蛋白降低了TGFβ活性和下调的中央胶原蛋白交联酶，这与纤维瘤蛋白在人类心脏成纤维细胞中的抗纤维化作用一致。
使用大型分子标记数据库对复杂性状的研究已重塑遗传育种程序，因为它允许从大量分子标记中直接纳入信息以预测基因组值。但是，大量标记可能会导致计算需求，多重共线性和维度的问题。我们在基因组广泛的选择研究中评估了多层感知神经网络来解决此问题，并提出了一种称为探针子集选择方法的新维度降低方法，以预测遗传值。我们使用模拟的F1人群来实现12个定量性状，包括不同的建模结构，平均优势和遗传力。多层感知器神经网络以及所提出的探针子集选择方法比RR-Blup方法提供了更准确的预测，并将均方根误差从577.249减少到低于24的值。计算智能在繁殖程序中的使用是一种有希望的出于预测目的的工具，由于上毒和优势并不是提出的多层感知神经网络方法的限制因素。
真菌引起的橙色生锈Puccinia kuehnii，导致甘蔗生产率较高。耐药性基因型的选择是甘蔗育种计划的目标之一。这种十字的父母的表型和分子表征对于获得优越的品种至关重要。我们评估了田间对橙色生锈的反应，疾病进化的模式，分子标记G1以及该信息在预测巴西国际宇宙网络的主要甘蔗父母中的耐药表型的有用性，用于甘蔗能量的发展部门（Ridesa）。为了进行此评估，包括63位甘蔗父母在Ridesa种质库中保守的，其中包括1970年至2000年的十字架。该实验是在完整的块设计中进行了三个复制的，使用克隆RB036145（易受橙色锈病）作为感染线。使用图表量表进行了11项严重性评估。根据疾病的严重程度数据，与SP79-2233品种的RAUDPC值相比，计算了疾病进度曲线（RAUDPC）下的相对面积（RAUDPC），并将基因型分类为抗性，中间体和易感性（与SP79-2233品种的RAUDPC值相比以及RB867515品种（对橙色锈蚀剂）。 Of the 63 sugarcane parents, 43 were classified as resistant, of which 27 were positive for the G1 marker; 10 as intermediate, including seven positives for G1; 10 were susceptible, among which four were positive for this marker. The molecular marker G1 showed an accuracy of 71% in predicting the resistant phenotype and could be used as a tool for the characterization of resistant germplasm.
山药豆（Pachyrhizusspp。）是一个未充分利用的豆类块茎，非常适合亚马逊气候。该豆的结节根（干重）具有5％至20％的蛋白质，尽管即使在巴西也鲜为人知。不建议在亚马逊地区改善品种。我们根据其性能检查了20个选定的山药库存和选定基因型的基因型X年级（GXY）相互作用。这些材料是从64种基因型中获得的，自然脱落的P. orosusXP. tuberosus。该实验是在2017年4月至2017年9月至2018年9月至9月在亚马逊中部进行的，在完全随机的块设计中，具有20种基因型，3个重复和每块植物，相距1 x 0.5 m在行内。培养六个月后收获豆荚和根。评估了POD和根部产量以及后者的近端组成。我们发现没有明显的GXY相互作用，用于POD和根部产量。然而，根中的碳水化合物，蛋白质，脂质，纤维和灰分含量显示出显着的GXY相互作用。这些结果表明，在该季节的干旱期间，可以在干旱期间的一年内选择具有高豆荚和根产量的基因型。但是，必须在数年内进行选择以增加其营养价值。用于呈现高根产量的选定基因型（> 3 T HA-1）是P7，P11，P15，P19，P37和P57。用于根部高蛋白质含量的基因型（> 10％干重）为P13，P14，P37和P62。
肝母细胞瘤（HB）是儿童最常见的恶性肝肿瘤。但是，导致其进展的分子机制尚不清楚。我们先前鉴定出卵巢癌免疫反应性抗原结构域的高甲基化，其中2（OCIAD2）作为HB脱节样品的全基因组甲基化分析中HB的预后因素不良。据报道，这种高甲基化OCIAD2失调的表达OCIAD2，阐明OCIAD2在HB中，我们评估了细胞功能的改变，例如使用细胞生长，侵袭和迁移能力OCIAD2HB的过表达细胞系。在里面体外分析OCIAD2过表达，两组之间的细胞增殖未观察到显着差异。但是，迁移和入侵能力明显降低OCIAD2过表达的细胞系。其次，过表达OCIAD2在每个细胞系中降低了基质金属蛋白酶2（MMP2）水平。这些结果表明OCIAD2抑制与MMP2相关的HB侵袭和迁移。
了解特质的遗传结构会塑造繁殖计划的整个策略。在这项研究中，目的是确定影响普通豆根遗传控制的加性和非加性作用。在2018/19的生长季节进行了一次现场实验，在部分平衡的不完整块设计中进行了75种治疗。处理由后代组成（l1- p1x f2，l2- p2x f2和我3- F1x f2）由三重测试交叉配合设计，中美洲父母p1-BAF50（活跃种质库的登录）和P2-IPR UIRAPURU（商业品种）。根据土壤发掘法评估了性格根分布，原位。为此，在每种植物下打开沟槽（每次复制，每种处理中有两种植物），并将网格插入开放型。根据沟槽中的网格拍摄图片，基于可以对根分布（百分比）进行定量评估的图片。为了比较根和射击生物量，在收获时计数豆荚和谷物的数量。通过建立预测功能，将治疗因子分为遗传效应（添加剂，显性和上毒）。加性遗传作用是遗传性状控制中最具影响力的。另一方面，添加剂×添加性上位数与植物的基因型值没有显着偏差，既没有针对根（P = 0.7941）也没有晶粒的产量成分。在评估的后代中，观察到的优势偏差和添加剂X主导性X和显性X显性epitisis的影响最少，并且性状根部分布中的表达具有相反的方向（正和负偏差），而对于屈服成分，非 -添加基因效应具有一种和相同的模式。在中美洲基因型之间的杂交中，根的遗传值基于平均遗传效应，而遗传相互作用可以忽略不计。
2型糖尿病（T2DM）是一种慢性，复杂，多因素和多基因疾病，构成了全球最大的公共卫生挑战之一。遗传背景已显示出强烈影响疾病的敏感性。我们对T2DM的风险变化和巴西人口并发症进行了遗传筛查。该系统审查在Prospero平台中注册，该编号CRD42020153032。这些搜索是在虚拟健康图书馆（BVS），EMBASE，PubMed/NCBI，Scopus和Web of Science数据库中进行的，其中包括仅将遗传多态性与巴西人群发展疾病的风险相关的病例对照研究。在搜索结果中，我们还提取了有关开发宏观/微血管并发症的敏感性的数据。包括16例病例对照研究，其中10个解决了T2DM易感性和疾病并发症的6种。共有4122个个体被包括在对T2DM易感性的分析中，而对疾病并发症的易感性易感性。我们的发现证明了四种主要机制参与T2DM病理生理学：糖酵解失调，脂质代谢，胰岛素抵抗和炎症过程。在与疾病易感性相关的八种多态性中，我们重点介绍了RS7903146（C/T）TCF7L2基因和RS1800471（25c/g）TGF-β1糖尿病性视网膜病的基因。在单倍型分析中，两组与T2DM易感性相关（adipoq和dio2基因），在UCP2基因与糖尿病性视网膜病和肾病有关。这项研究的数据表征了巴西人口对T2DM易感性及其并发症的遗传特征。这是第一个遗传流行病学研究，用于筛选巴西这种疾病相关的风险变异。通过此映射，我们旨在为分子诊断技术和精确医学的发展做出贡献，例如在巴西人群中用于T2DM易感性的遗传面板。
属Corydalis（Papaveraceae）分布在北半球的温带区域，主要根据形态学和分子基因组信息进行了分类学研究。在本研究中，属于韩国部分的14种物种Corydalis在韩国收集，并使用四个叶绿体基因组区域进行系统发育分析，其中包括matk，，，，RBCL，，，，RPL16基因和trng内含子。作者试图在系统发育分析中包括核内部转录垫片（ITS）区域。然而，观察到的多个PCR波段和各种频带大小，得出的结论是，其区域不适合于系统发育研究Corydalis。当分别分析四个叶绿体基因组区域时，观察到不同水平的物种划界分辨率，在大多数情况下，分辨率水平非常低。什么时候matk和RPL16被串联，观察到最高的物种划界分辨率。但是，当将其他区域添加到该串联区域以改善分辨率时，决议减少了，这与作者的期望相反，值得进一步分析。同时，作者在本研究中观察到了基于形态学和分子系统发育的先前建立的分类学之间的不一致。这种差异需要进一步详细解决，以便该属的分类法Corydalis可以完全融合形态和分子基因组信息。总体而言，本研究提供了有关分类法的见解Corydalis，并清楚地表明，叶绿体标记的正确组合可以导致该属中该物种的成功歧视。实际上，这项研究提出了在这个有趣而复杂的分类单元中更好地利用系统发育分析和物种划界的方法。自从Corydalis这项研究在分类学上具有挑战性，被广泛用作亚洲的药用植物，可以成为该属的宝贵信息来源。
基孔肯雅病毒（chikv）是家庭的RNA病毒togaviridae主要由艾德斯蚊子。巴西Chikv感染的第一份报告可以追溯到2014年；从那时起，该病毒已成为一个重大的公共卫生挑战。这项研究的主要目的是对2017年爆发期间Espirito Santo（ES）状态的CHIKV分离株进行系统发育分析，以鉴定循环CHIKV菌株的遗传多样性。对CHIKV RT-QPCR确认的病例进行了系统发育关系推断和分子表征的测序。系统发育结果表明，2017年ES爆发中的病毒属于ECSA基因型。分子表征揭示了ES菌株中的新突变（E2-N207D）。这种变异通过将天冬酰胺（n）交换为在207位的天冬氨酸（d）产生氨基酸取代，并且与锚固凹槽相关，可能会干扰病毒包络组件以及与靶细胞相关的相互作用。在这里，我们报告了一次Chikv-ECSA IIA爆发，表明ES人口对巴西其他地方循环的该病毒菌株的脆弱性。尽管样本量很小，但本研究描述了有关CHIKV在ES状态下的系统发育数据，该数据有助于扩展病毒基因型数据库，并揭示了一种新的E2蛋白CHIKV变体（E2-N207D）。这些数据有助于提高对Chikungunya热的了解，以设计有效的公共卫生控制策略。