在木薯淀粉通路基因的多态性。
文摘
的分布和频率单核苷酸多态性(snp)可以帮助了解感兴趣的变化与特点。我们的目的是评估在6基因核苷酸多样性木薯淀粉生物合成中使用的96不相关的登记入册。基因测序,对齐,用于获得核苷酸多样性值(π),隔离网站(θ),日本田岛D测试,neighbor-joining (NJ)集群。平均每147年和171年英国石油公司被确认一个SNP外显子和内含子区域,分别。十三个杂合的位点被发现。三个外显子地区的七个snp导致非同义替换或四个同义替换。但没有协会指出,单核苷酸多态性和根干物质含量之间的关系。π的参数范围从0.0001(颗粒结合淀粉合酶I)到0.0033(α-amylase),平均0.0011,而θ的范围从0.00014(淀粉分支酶)0.00584(淀粉合酶I),场均0.002353。θ多样性值通常π的两倍。D测试的结果并没有建议任何证据中立在这些基因的异常。 Among the evaluated accession, 82/96 were clustered using the NJ method but without a clear separation of the root dry-matter content, root pulp coloration, and classification of the cyanogenic compound content. High variation in genes of the starch biosynthetic pathway can be used to identify associations with the functional properties of starch for the use of polymorphisms for selection purposes.