使用ME-DIP测序技术，盐度压力诱导的盐（棉质Hirsutum L.）的DNA甲基化改变的全基因组分析。

胞嘧啶DNA甲基化是与真核生物，真菌，动物和植物中基因表达密切相关的DNA修饰的一种重要形式。尽管已经公开获得棉花的参考基因组（Gossypium hirsutum L.），但盐度诱导的棉中盐度诱导的DNA甲基化合体的改变尚不清楚。在这里，我们使用甲基化的DNA免疫沉淀测序方法构建了棉叶在盐应激下的全基因组DNA甲基化特性的图。结果表明，第9染色体上的甲基化读数与其他染色体上的甲基化读数最为可比，但是在盐胁迫下，在8染色体上发生的最大变化发生在盐胁迫下。DNA甲基化模式分析表明，在CDS区域和CG岛的上游2K和下游2K元素中发现了相对较高的甲基化密度。几乎94％的读数属于LTR-GSPSY和LTR-COPIA，LTR-GYPSY中甲基化读数的数量是对照和应力样品中LTR-Copia的四倍。对差异甲基化区域（DMR）的分析表明，上游2K，内含子和下游2K的基因元素是甲基化的，但CDS区域是高甲基化的。GO（基因本体论）分析表明，甲基化的基因最富含细胞过程，代谢过程，细胞部位和催化活性，这可能与对NaCl应激的反应密切相关。在这项研究中，我们完成了基因组DNA甲基化谱，并在盐应激下进行了DMR分析，该分析提供了有价值的信息，以更好地理解表观遗传学，以应对棉中的盐胁迫。bob综合app下载