研究文章
sNP比较图和guava物理地图
bobapp苹果版安全吗发布日期:2022年5月25日
创用CC模尔解析21(2):GMR19033
DOI:https://doi.org/10.4238/gmr19033
引用此文章
F.L.B.美德罗斯市Santos A.E.S.科斯塔2022sNP比较图和guava物理地图
创用CC模尔解析21(2):GMR19033
https://doi.org/10.4238/gmr19033
2 027视图
抽象性
基因组映射简化表示染色体中的分子标记或核酸序列开发精密地图对标识辅助选择至关重要我们开发并比较使用JeinMap4.0和GACD获取的遗传联系图与使用BLAST分析获取的物理地图欧卡利普图斯sNP转至guavaPsiumguajamyrtaceae- 用作本作物特征映射参考euchip60KSNP芯片2.0版(72202SNPss)实验交叉法79%的SNP单态化数据过滤后使用1120标记构建地图JoneMap4.0链接图有203标记,覆盖1405.2cm,平均标记距离7.7cmGACD链路图有186个标记并横跨1392.7cm,平均标记距离为8.8cmJoneMap和GACD对估计距离和SNP排序有不同意见GACD显示比JitMap4.0高限值,因为它按父母原创点标标记BLAST物理地图由694点击组成(电子值8xE-10to 1.15xE26平均标记区间为0.62Mb与物理映射相比,两个链接映射图显示关联组数色谱显示限制值这些结果突出显示通过BLAST物理映射的有效性,以克服联系映射限制,如标记分组和排序中的限制物理地图建议可参考guava绘图和QTL估计.